Хотя вообще считают, что психологическое напряжение влияет на менструацию, исследования взаимоотношений стресса и менструальной функции предусматривают изучение преимущественно значительных изменений в жизни, катастрофических событий, таких как лишение свободы, война, покидание девушками родного дома. При исследовании обнаружили, что через 5-8 лет после начала первой менструации 72% девушек, проживающих дома, имеют нормальную овуляцию по сравнению с 40% тех, которые живут далеко от дома. В старших женщин отделения от семьи имело лишь минимальный эффект.

Данные популяционных исследований менее последовательны. В одномоментных исследованиях наличие в анамнезе эмоционального стресса, смерти или отделения от близких родственников и осознания чрезмерной физической или умственной рабочей нагрузки не отличалась у женщин с аменореей и у женщин без аменореи, в то же время психологическое состояние и события жизнь не были связанные с чрезмерным менструальным кровотечением.

Исследование острых стрессовых ситуаций в течение менструального цикла показало, что важные события жизни, связанные с потерей и отделением, случались крайне редко, поэтому они не объясняли смену цикла в этой совокупности молодых женщин, но события, связанные с определенным достижений или новизной, такими как новая работа, вступление в ВУЗ, новые отношения, увеличивают вероятность наличия длительного цикла.

Как и в случае с физической активностью, механизм, через стресс влияет на менструальную функцию и остается неопределенным. Центральные психогенные нарушения опосредуются гипоталамусом через изменения в уровнях пролактина или эндогенных опиатов. И наоборот, системная физиологическая реакция на стресс, такая как, например, повышение базального уровня кортизола, может вызвать изменения в реакции гипоталамуса.

Одно из исследований показало недостаточность лютеинизирующего гормона (LH) у женщин с аменореей, которые сообщили о стрессовых событиях в их жизни, и уменьшенную амплитуду колебаний уровня LH у женщин, которые имеют клинические критерии тревожного состояния или депрессивных расстройств. У женщин с функциональной гипоталамической аменореей также обнаружено высокие концентрации кортизола и уменьшенную реакцию на введение гормона, который высвобождает кортекотропин (CRH), по сравнению с женщинами с другими формами ановуляции или женщинами без менструальных нарушений.